水質科掌理事項如下: 一、 公共污水下水道計畫之擬訂及工程建設。 二、 公共污水下水道系統設施之操作及維護。 三、 納入公共污水下水道接管申請案件之設計圖說審查及竣工查驗。 四、 專用污水下水道之納管總量管制與相關申請案件之審查及竣工查驗。 五、 公共污水下水道之緊急應變處理。 六、 環境改善維護之執行。 七、 其他有關水質事項。